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EHEC-Genom entschlüsselt: hoch-toxischer EHEC-Stamm ist eine Chimäre
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Forscher am BGI (ehem. Beijing Genomics Institute, Peking, China) haben in Kooperation mit dem UKE das Genom des EHEC-Stammes sequenziert, der für die aktuellen EHEC- bzw. HUS-Ausbrüche in Deutschland verantwortlich ist (NCBI, SRA No: SRA037315.1 oder download unter ftp://ftp.genomics.org.cn/pub/Ecoli_TY-2482). In nur drei Tagen nach Erhalt der bakteriellen DNA-Proben konnten die BGI-Forscher mit Hilfe ihrer Sequenzierungsplattform der neuesten Generation (Ion Torrent von Life Technologiesc) und bioiformatischen Analysen feststellen, dass es sich um einen neuen, hoch-toxischen und infektiösen E. coli-Stamm mit einer Genomgröße von ca. 5,2 Mb handelt.
EHEC-Erreger ist eine gefährliche Chimäre - ein natürlicher GMO
Die Sequenzanalyse zeigt, dass der Errger ein EHEC Serotype O104 E. coli Stamm ist, allerdings ein neuer Serotyp, der bisher nicht in irgendwelche EHEC-Ausbrüche verwickelt war. Er ist eine Chimäre - man könnte auch sagen ein natürlicher GMO (Genetisch Modifizierter Organismus) - dessen Sequenz zu 93% dem EAEC 55989 E. coli Stamm entspricht, der für einen Diarrhoe-Ausbruch in Zentralafrika verantwortlich war. Außerdem enthält er aber auch spezifische Sequenzen, die für HUS-Erkrankungen (Shigatoxin-Bildung) verantwortlich sind. Diese drei Gene könnten durch horizontalen Gentransfer eingefügt worden sein.
Resistenz gegen Antibiotika
Die Analysen zeigten ausserdem, dass das tödliche EHEC-Bakterium verschiedene Gene für Antibiotika-Resistenz (u.a. gegen Aminoglycoside, Macrolides und Beta-lactam-Antibiotika) enthält, was die Behandlung der EHEC-Infektion extrem erschwert.
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Schlüsselwörter : Bakterien-DNA BGI DNA EAEC 55989 EHEC Genetik Genom Genomsequenz GMO horizontaler Gentranfer HUS Sequenzierung Sequenzierungsplattform Serotyp O104 Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf
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